神祕果的修剪方法主要包括以下幾點：
去頂芽。去除頂芽可以抑制植物的高度生長，促進分支，適用於已經穩定的老樁。一般剪掉枝條的五分之一。
修剪瘦弱枝條。對於瘦弱的枝條，建議剪掉二分之一，以促進快速生長和發新枝。
園林種植修剪。在園林環境下種植的神祕果，建議留下兩個癟芽，其餘剪掉，以便於造型。
除掉多餘枝條。對於因受傷等原因長出的多餘分支，應及時去除，避免影響植株整體效果。
自然開心形修剪。採用自然開心形進行修剪，合理分佈枝條，選擇長勢強、健壯、生長方向不同的芽作爲側枝。
去除密枝和雜枝。在掛果時去除過於密實的密枝和雜枝。採收後及時清除有病蟲害的枝幹。
年度修剪和夏季修剪。每年冬季或早春進行一次全面修剪，剪除死枝、病變枝和受損枝。夏季期間進行細微修剪，去除不想要的芽眼和側枝。
蔓延修剪。對於蔓生植物，控制和引導蔓延的枝條，保留健康的主幹和有望產生果實的側枝。
根據新梢抽發時期採取不同方法。如拉枝、撐枝、斷頂等，以增大樹體冠幅，降低樹體高度，剪除多餘的、擁擠的和無用的枝梢。
彎幹彎枝技術。對於果樹，採用彎幹彎枝技術，避免枝條相互交叉，利於耕作，增加枝量並提早結果。
總之，神祕果的修剪應結合植株的具體情況和生長環境進行，目的是促進健康生長、提高產量和美化樹形。