禪宗六祖的故事有很多，以下是其中幾個：
1. 慧能得法：一日，五祖對眾弟子說：“我今天要外出雲遊，你們好好做早晚二供。”隨後就將衣缽傳位和佛法傳授給當時只十五歲的慧能，而大弟子神秀作偈：“身是菩提樹，心為明鏡台，時時勤拂拭，莫使惹塵埃。” 慧能隨後也作了一個偈子：“菩提本非樹，明鏡亦非台，本來無一物，何處惹塵埃。”六祖慧能得到了五祖的衣缽傳位和佛法傳授。
2. 慧能逃難：慧能得到衣缽傳位後，受到了當時南方諸王的追殺。一次在路上行走時被官兵抓住，要把他送到官府。但他機智地謊稱自己是胡人，不懂禮法，官兵把他當作逃亡的士兵而釋放。後來他又輾轉來到韶州（今廣東韶關）曹溪寶林寺隱居。
3. 六祖開悟：一日晚飯後，慧能到碓房裡碓米。碓房裡有個和尚請求慧能將米升到碓磑上。由於夜色昏暗，突然之間，慧能聽見一聲叫喊：“我要吃肉！”他吃了一驚，猛然間心生驚悟。此後慧能勤學苦練禪定和佛法，並得到了真正的開悟。
這些故事展示了禪宗六祖慧能的智慧、機智和悟性，也表達了禪宗注重內心覺悟、超越世俗束縛的思想。