《秋之回憶6：Next Relation》的故事發生在《秋之回憶5》的數年後，玩家將扮演主角艾拉，與青梅竹馬的真琴、朋友們的羈絆繼續發展下去。本作的主要劇情圍繞著艾拉與新角色神倉冬夜之間的感情故事展開，同時還有其他的支線劇情，涉及角色們的過去和現在的生活。
在這個故事中，玩家將看到角色的成長和變化，以及他們面對各種問題和挑戰時的態度和選擇。故事的主題包括友情、愛情、成長、犧牲和選擇，探討了人性和人際關係中的複雜性和多樣性。
此外，本作還引入了新的元素和機制，如Next Relation系統，玩家可以與角色發展更深入的關係，並對其產生影響。這種新的關係系統為玩家提供了更多的自由度和選擇，讓他們能夠更好地理解和干預角色的命運。
總的來說，《秋之回憶6：Next Relation》的故事圍繞著角色們的成長和羈絆展開，探討了人性和人際關係中的各種主題，同時引入了新的機制和元素，為玩家提供了更多的自由度和選擇。