科斯定理的局限性主要包括以下幾點：
交易成本的現實考量：科斯定理通常假設交易成本為零，但這一假設在現實中很難成立。當交易成本很高時，科斯定理的有效性會受到質疑，因為在實際操作中，資源的有效分配可能會因為高昂的談判和交易成本而難以實現。
產權界定的困難：有些資源的產權界定可能存在困難，甚至在某些情況下是不可能的。這意味著在現實中，不是所有資源都能夠明確界定產權，從而限制了科斯定理的套用。
談判成本和參與者的數量：科斯定理假設談判必須是公開的、無成本的，這在大多數外部經濟影響的情況下是很難做到的。當涉及多個當事人時，不僅交易成本會增加，而且可能出現「免費搭車者」問題，即某些人不參與談判卻能夠獲得好處。
外部經濟影響的複雜性：科斯定理在處理外部經濟影響時，假設與問題有關的當事人數量有限，這在實際中可能不成立。在涉及大量廠商或個人時，談判的複雜性和成本可能會使得科斯定理的理想狀態難以實現。
綜上所述，科斯定理雖然在理論上為資源分配和產權問題提供了清晰的框架，但在實際套用中，由於交易成本的現實考量、產權界定的困難、談判成本和參與者數量的限制以及外部經濟影響的複雜性，其有效性可能會受到限制。