秦姓的起源主要有兩種說法：
出自嬴姓。它是顓頊帝的後裔，伯益（顓頊帝的曾孫）因輔佐大禹治水有功，被賜姓嬴。伯益的後代非子被周孝王封在隴西秦亭，成為周朝的附庸國，最終形成了秦國。公元前221年，秦王嬴政統一六國，建立秦朝。秦朝滅亡後，王族子孫以國名為姓，稱為秦姓。
出自姬姓。周公旦之子伯禽的後代中有人食采於秦邑（今河南省範縣北），其後代以邑為姓，稱秦氏。
這兩種說法表明秦姓在中國歷史上有著悠久且多元的起源。另外，元朝和清朝時期，也有蒙古族和滿族人改姓為秦。秦姓在中國的分布較廣，主要集中於河南、廣西、河北、四川、山西等省區。