紅樹林是熱帶和亞熱帶海岸溼地生態系統中獨特的生態系統，它不僅爲多種植物提供了棲息地，也是衆多動物的家園。以下是一些在紅樹林中生活和棲息的動物：
海龜。如紅樹林龜（鑽紋龜），這是一種能在鹹水中生存的海龜種類。
長鼻猴。這是一種罕見的瀕危靈長類動物，僅生活在婆羅洲的紅樹林中。
紅肛鳳頭鸚鵡。這種鳥類因其尾羽內側的紅色羽毛而得名，原產於菲律賓羣島。
馬島斑麻鴨。這種瀕危的鴨子僅在印度洋島國西岸的紅樹林中生活。
黃肩黑鳥。這種瀕危的黑鳥僅見於波多黎各，也是紅樹林的棲息者。
招潮蟹、跳跳魚、中華鱟、白鷺。這些動物在紅樹林中停歇、覓食。
勺嘴鷸、黑臉琵鷺、黑嘴鷗、遺鷗。近年來，在湛江紅樹林溼地記錄到了多種珍稀鳥類。
海蟹、跳跳魚、中華鱟、白鷺。在紅樹林下停歇、覓食。
篩目貝、硨磲、櫛孔扇貝、糙鳥蛤和馬蹄螺、鳳螺、粒核果螺。這些是紅樹林中常見的貝類動物。
此外，紅樹林還是多種浮游生物和浮游動物的棲息地，如硅藻、角毛藻、半管藻等浮游藻類，以及新哲水蚤、波水蚤等。