羊肚菌幼菇死亡的原因有多種，主要包括以下幾點：
環境濕度不當。這是導致羊肚菌幼菇死亡的主要原因之一。如果土壤濕度過高，會導致通氣不良，幼菇可能被水漬死或因細菌病害而死亡。相反，濕度過低則可能導致幼菇乾枯而死。
環境溫度不適宜。羊肚菌幼菇對環境溫度有特定的要求，一般在20℃左右生長最佳。溫度過高或過低都會導致幼菇死亡。
養分供應不合理。養分不足或過多都會影響幼菇的正常生長，導致其死亡。
病菌感染。由於羊肚菌幼菇生長環境潮濕，容易滋生病菌，如炭疽菌、褐斑病菌、根腐病菌等，這些病菌感染幼菇後，會導致幼菇死亡。
通風不良。通風不暢會導致缺氧，濕度小時則會造成幼菇脫水死亡。
光線過強。過強的光線可能會傷害菇尖，導致幼菇死亡。
泡水死亡、乾旱死亡、極端溫度死亡（過熱或過冷）、營養不足或過量死亡、蟲害或病害死亡。這些因素都可能導致羊肚菌幼菇的死亡。
為了確保羊肚菌幼菇的健康生長，應根據實際情況調整環境濕度、溫度、養分供應，並採取措施防止病菌感染和通風不良等問題。