基底層的作用主要包括：
細胞分裂與再生：基底層是表皮細胞的發源地，具有分裂、繁殖、再生表皮的作用。基底細胞能夠不斷地分裂新的細胞，這些細胞會逐漸向上推移，直到形成角質層，進而維持皮膚細胞的新陳代謝。
修復受損細胞：新生的細胞會逐漸分化成角質層細胞，對於皮膚修復以及鎖水有重要作用。
抑制色素沉著：細胞脫落過程中能夠防止色素沉著，若基底層受損，則可能導致黑色素堆積，易生成色斑。
維持皮膚水油平衡：基底層含有乳化酶，可以將皮膚里的水和油融合在一起，有助於維持皮膚的水油平衡。當基底層受損時，可能會出現水油分離、外油內乾等皮膚問題。