肽聚糖是細菌細胞壁的主要成分，由雙糖單位、四肽尾和肽橋組成。具體結構如下：
雙糖單位。由N-乙醯葡萄糖胺（NAG）和N-乙醯胞壁酸（NAMA）通過β-1,4糖苷鍵交替連線形成。
四肽尾。四肽尾的組成在不同細菌中有所不同，例如，革蘭氏陽性菌的四肽尾通常包含L-Ala、D-Glu、L-Lys、D-Ala，而革蘭氏陰性菌的四肽尾則包含L-Ala、D-Glu、m-DAP、D-Ala。
肽橋。肽橋是連線不同四肽尾的結構，其組成多樣，例如，在某些革蘭氏陽性菌中，肽橋可能是甘氨酸五肽，這種肽橋將一個四肽尾的C端D-Ala與另一個四肽尾的L-Lys連線起來。
肽聚糖的結構賦予細菌細胞壁以強度和穩定性，使其能夠抵抗外界壓力和保護細菌免受某些抗生素的影響。