自考本科和函授本科主要有以下幾個區別：
入學方式不同。自考本科沒有入學考試，考生可以根據自己的情況選擇相關專業並開始學習；函授本科則需要通過成人高考，這是一種全國統一的入學考試，有一定的門檻。
學習年限不同。自考本科沒有固定的學制，考生可以根據自己的進度完成學業；函授本科有固定的學制，一般為2.5年。
報考條件不同。自考本科報考條件較為寬鬆，幾乎不受性別、年齡、民族、種族的限制；函授本科則通常要求考生具有一定的高中文化程度或相應的專科畢業證書。
考試難度和含金量不同。自考本科的考試難度較高，但其畢業證含金量也相對較高；函授本科的考試難度相對較低。
學習方式不同。自考本科以自學為主，適合自主學習能力強的考生；函授本科結合了自學和面授，更適合需要靈活安排學習時間的在職人員。