自考本科的科目主要分為以下幾個類別：
公共課。所有專業必考的科目，一般包括《中國近現代史綱要》《馬克思基本原理概論》和《英語二》這三門課程。此外，理工科類專業還可能包括《高等數學》和《線性代數》等科目。偏套用性質的專業可能會要求學習《計算機套用基礎》或《管理系統中計算機套用》等課程。
專業課。這一部分與考生的專業知識、技能直接相關。專業課的設定由各主考學校根據專業教學要求決定。專業課可能包括必考課和選考課，考生需要根據學分要求選擇相應的課程進行學習。
換考課程。主要針對英語自學難度較大的考生，這些學生可以選擇多考3到5門其他課程來代替《英語二》的學分。
畢業論文（設計）。對於自考本科學生，如果所有考試科目成績達到一定標準，可以申請進行畢業設計或撰寫畢業論文。
不同專業的課程設定可能有所不同，具體要求以各專業和院校的安排為準。