船舶事故的原因可以從以下幾個方面進行分析：
人員因素。船員的身體狀況、知識水平、駕駛技能、思想意識等都會直接影響到船員的行為，進而影響事故的發生。
船舶因素。包括船舶動力設備、操作設備、安全設備和通信設備等的性能和狀況，船舶材料和質量，船體結構、強度、密封性和分艙布置，以及船舶的吃水、穩定性和慣性等。
貨物因素。貨物的特有屬性（如貨物的揮發性、易燃易爆性、毒性等）不了解，或在貨物的分類、處置、堆裝、固定和運輸保管等方面處理不當，容易引發事故。
環境因素。自然環境如氣象條件（風、雪、雨和霧等）、水文條件（流速、流態、漲水和退水等）和航道條件（航道寬度、深度、曲率半徑、水下障礙物和助航標誌等），以及通航環境如通航密度、交通秩序、靠（錨）泊條件、橋梁及架空電纜高度、背景燈光、港口設施的狀況和安全信息等。
管理因素。包括配載和積載不當，貨艙及設備不符合裝載要求，裝卸操作不當，運輸途中貨物管理不當，貨物到港交接管理不當，貨物自身原因以及不可抗力原因等。
其他潛在因素。如經濟因素（經濟平穩和經濟動盪時期，水上交通安全形勢會呈現出不同的特徵）、社會文化體系因素等。
這些因素之間相互影響，共同作用於船舶事故的發生。