苦丁茶的保存方法有多種，效果最好的是冰箱保存。具體來說，應將苦丁茶裝入高密度的無異味包裝袋或真空包裝袋中，然後放置在冰箱的冷凍室或冷藏室內。
此外，還可以使用鐵罐、瓦罐等容器保存苦丁茶。在保存前，應確保容器內部乾燥、無異味，最好無鏽跡。瓦罐保存時，建議在罐中放入適量的生石灰，以吸收溼氣和異味，保證茶葉品質，生石灰大約每兩個月更換一次。
熱水瓶也是一種可行的保存方法，但需保持瓶內乾燥，將苦丁茶倒入瓶內，並密封瓶塞。
需要注意的是，無論採用哪種保存方法，都應避免苦丁茶受高溫暴曬或接觸空氣，以防發黴。此外，苦丁茶的保存期限一般爲一年，六個月內飲用最佳。