清洗茶樹菇的方法取決於它是新鮮的還是乾的，兩者步驟有所不同。
對於新鮮茶樹菇，應該先用流水沖洗兩邊，然後用淡鹽水泡一會兒，使用時再簡單清洗即可。而對於幹茶樹菇，處理過程更爲複雜，因爲幹茶樹菇在處理過程中可能會有泥沙殘留。具體步驟如下：
首先用溫水泡發乾茶樹菇，完全泡發後清理根部。
使用流水沖洗乾淨，可以用淘米水或淡鹽水再泡15分鐘左右。
再次用流水沖洗，邊洗邊捏幹裏面的水分，以最大限度地清洗乾淨。
在清洗過程中，一定要使用流水，以避免洗掉的髒物重新附着到乾淨的茶樹菇上。此外，有建議使用淡鹽水或淘米水進行初步清洗和泡發，這有助於去除雜質和殘留物。淘米水因其鹼性有助於保留營養成分。在清洗時，還可以剪去幹茶樹菇根部的硬蒂，因爲這部分通常含有較多泥沙，不易清洗。