使用菜肥的方法主要包括以下幾種：
底肥。在種植或移栽前施用，常用的底肥包括廚餘堆肥、雞糞、餅肥、商品有機肥等。這些肥料應適量放置，通常佔盆土體積的十分之一左右。底肥可以直接混入土壤中，或者放在花盆底部後再覆蓋土壤。
種肥。使用腐熟乾燥的有機肥伴土作爲種肥，與種子一起播種。注意肥料用量不宜過多。
追肥。在植物生長過程中定期施用，追肥分爲固體肥和液體肥兩種。固體肥通常包括餅肥、雞糞、草木灰、商品有機肥等，一般每月使用一次。液體肥可以通過直接衝施、稀釋後澆灌或噴葉的方式施用，液體肥一般每週使用一次，施肥原則是寧稀勿濃。
此外，自制有機肥也是一種選擇，如將廚餘、動植物殘渣等通過發酵處理製成肥料，這些肥料含有豐富的營養成分，有利於植物生長。每種肥料的使用方法和時機應根據蔬菜的生長週期和需肥特點來決定。