菩提塔在佛教中具有重要的寓意，它主要是為了紀念釋迦牟尼佛在菩提樹下修煉成佛，降伏妖魔，並學會了佛道的真諦而建。菩提這個詞在佛教中代表著智慧，象徵著人的大徹大悟和豁然開朗。菩提塔通常與佛陀在菩提伽耶菩提樹下成就無上道境的時刻相聯繫，因此它也被稱為降魔塔，意味著降伏魔障，達到覺悟。
在藏傳佛教中，八大佛塔象徵著佛祖的一生八大功德，包括誕生、成道、弘法、降魔、天降、和好、法身、涅槃等。菩提塔是其中之一，與其他七座塔一樣，各自代表著佛祖不同的功德。
菩提塔的建築形式也有其特定的含義。它的方形四階層塔座沒有任何修飾，傳統上要求台階的上部邊緣凸出其高度的1/4，使之看上去更漂亮。這種設計可能是為了象徵佛塔的穩定性和莊嚴。
此外，菩提塔還被視為諸佛身、口、意的象徵，其形狀依據地、水、火、風、空等五輪之相形成。塔內裝藏開光後，可供人禮拜，塔身表示佛的色身與大悲意，同時也象徵三界：塔瓶表示欲界、塔頸表示色界、其上表無色界及空大、十三級階梯代表十三地，上部日月光表示佛光普照。