菩提子樹是一種高大的常綠喬木，樹皮呈灰白色，樹幹可高達15至25米，胸徑達30至50厘米。
菩提子樹的樹冠廣闊，樹皮平滑，可能帶有微縱紋。其葉片為革質，三角狀卵形，表面深綠色且具有光澤，背面為綠色；葉片的先端驟尖，頂部延伸呈尾狀；基部寬截形至淺心形；全緣或波狀。菩提子樹的花期在每年的3至4月，果實成熟期則在5至6月。其花朵和果實特徵分別如下：
花朵。菩提子樹的花朵總花梗長4至9毫米，雄花少，生在近口部，無花柄，花被2至3裂，內卷，雄蕊1枚，花絲短。癭花有柄，花被3至4裂，花柱短，柱頭膨大。雌花無柄，花被片4片，子房球形，花柱纖細，柱頭狹窄。
果實。菩提子樹的榕果球形至扁球形，直徑1至1.5厘米，成熟時為紅色且光滑。
此外，菩提子樹還具有懸垂氣根，樹幹可能分泌出乳汁。