萘乙酸是一種植物生長調節劑，具有多種農業套用，可以通過不同的方法使用，如葉面噴施、浸種、根部澆灌等。不同的植物和套用目的需要不同濃度的萘乙酸溶液，例如，葡萄扦插和樹木移栽時，可以使用100到200毫克每升的藥液蘸根以促進生根發芽；甘薯和蘿蔔可以用10到20毫克每升的藥液蘸基部，然後移栽以提高成活率和產量；在果類的開花坐果期，使用5%的萘乙酸水劑4000到5000倍液噴施可以防止落花落果。
在使用萘乙酸時，需要注意劑量的控制，避免使用過量導致植物生長異常或產生負面效應。同時，應選擇合適的使用時機，以獲得最佳效果。在使用過程中要注意安全，避免接觸皮膚和眼睛，使用後及時清洗噴霧器，以免殘留的萘乙酸溶液對其他作物造成影響。
由於萘乙酸難溶於水，在配置時可以先加入少量的酒精進行溶解，然後再加入水調成糊狀，最後加入小蘇打攪拌到全部溶解為止。