儲存雞蛋時，應確保大頭向上，因為雞蛋大頭有一個氣囊，可以阻止蛋黃與蛋殼貼近，防止蛋黃上浮貼在蛋殼上。如果雞蛋儲存在冰櫃里，取出後應儘快食用，不宜再次放回冰櫃，因為溫度變化可能導致雞蛋表面凝結水珠，細菌和病毒會順著水珠滲入蛋殼，污染蛋液。在沒有冰櫃的情況下，可以將雞蛋放在大米中保存，大米能提供低溫環境並吸收水分，有助於延長雞蛋的保存時間。
雞蛋的外殼有一層天然保護膜，即角質層，可以防止細菌侵入。因此，不建議清洗雞蛋，以免破壞這層保護膜。同時，應避免將雞蛋與揮發性物質如蔥、姜、辣椒等一起存放，因為這些物質的氣味會通過蛋殼氣孔滲入雞蛋，加速變質。
在常溫下，雞蛋的保存時間受溫度和濕度影響。在北方夏季可以存放三十天至三十五天，冬季在十五攝氏度以下可存放四十天至五十天。而在溫度高和潮濕的南方，可能只能保存二十五天至四十天。