蛋殼可以作爲一種多功能的有機肥料，用於改良土壤和促進植物生長。以下是蛋殼作爲肥料的幾種常見用途：
蛋殼粉末。將清洗乾淨的蛋殼曬乾或烘乾後，磨碎成粉末狀，可以直接混入土壤中，或者撒在植物的根部，爲植物提供鈣、磷、鎂等微量元素，同時調節土壤的酸鹼度，適合喜歡微鹼性土壤的植物，如君子蘭、茶花、桂花等。
蛋殼液體肥料。將蛋殼清洗乾淨後，放入塑料瓶中，加入自來水或白醋，發酵一段時間後，得到的液體肥料稀釋後可用於澆灌植物，能爲植物提供鈣、磷、鎂等營養元素，並增加土壤的活性和通透性，適合喜歡微酸性土壤的植物，如西紅柿、韭菜、草莓等。
發酵蛋殼肥料。將清洗乾淨的蛋殼曬乾後搗碎成小塊，與其他廚餘垃圾（如菜葉、果皮、茶渣等）混合，加入水和糖（或米醋）發酵一段時間後，得到的肥料含有多種營養元素和有益菌羣，能增強植物的抗病蟲能力和生長活力。
高溫加熱法。將蛋殼曬乾後，揉搓成粉末狀，放在瓦片上加熱，使其顏色變黃，轉化爲可被植物吸收的鈣肥。
此外，蛋殼還可以直接作爲植物的礦物有機肥料，無論是作爲底肥還是土壤改良劑，都有助於增強土壤的疏鬆透氣性和排水性，防止土壤板結，從而促進植物根系的強壯和植物整體的健康生長。