行政成本分析涉及對政府行政過程中產生的費用進行詳細考察，包括但不限於人工成本和公務成本。人工成本主要指公務員的招聘、錄用、使用、培訓、工資福利和社會保障等開支，而公務成本則涵蓋政府行政管理職能所需的各種費用，如會議費、接待費、郵電費、交通費、出國考察費等。
行政成本的特點包括總量逐年增長、行政管理費增長率高，以及公務成本在行政成本中占比較大。例如，1995年至1998年間，政府人工成本從11.9億元增加到21億元，公務成本中公款吃喝、公車私用、公費旅遊等現象普遍存在。
行政成本面臨的主要問題包括缺乏法制約束、開支盲目、缺乏計劃性、監督不力導致的浪費嚴重，以及公私不分、隱性消費等。這些問題導致行政支出效率低下，與工作績效背離。
部門行政成本分析的重要性在於它不僅符合社會視角的要求，還有助於審計職能的需求和降低審計風險。通過關注預算編制、行政成本的結構分析，以及套用成本分析方法如指標對比法、因素分析法等，可以有效管理和降低行政成本，提高政府工作效率和透明度。