《衝上雲霄2》的結局是一個大團圓的形式，所有的主角都找到了屬於自己的幸福：
何年希最終選擇了唐亦琛，儘管她最初在唐亦琛和顧夏陽之間感到左右為難，但最終決定與唐亦琛在一起。
唐亦風和顧夏晨也修成正果，兩人最終走到了一起。
高志宏和方芮嘉的關係公開後，高志宏成功求婚，兩人最終結婚。
凌卓芝和詹子麟在法國舉行了婚禮，得到了家人的支持。
此外，劇中雖然大多數角色都找到了幸福的結局，但張智霖飾演的角色似乎選擇了獨自一人，他以一段獨白結束了全劇，暗示了他選擇了一個人生活的方式。這段獨白和張智霖的空軍打扮登場，似乎在暗示《衝上雲霄》系列可能還有續集。
觀眾對《衝上雲霄2》的結局反應積極，平均收視率在31點以上，是當年收視率最高的港劇之一。