豆芽的保存方法主要有以下幾種：
常溫保存。將豆芽清洗乾淨後，放入盆中，加入清水浸泡，然後放置在通風良好且陰涼的地方。這種方法適用於短期內的保存，一般可保持一天左右，但可能會使豆芽的營養價值降低。
冰櫃冷藏。將豆芽的根須掐掉後清洗乾淨，瀝乾水分。然後將豆芽放入保鮮袋或保鮮膜中，儘量排出空氣，密封後放入冰櫃冷藏。這種方式可以保存豆芽約三天，是較為常用的保存方法。
冰櫃冷凍。清洗乾淨的豆芽可以放入冰櫃冷凍保存。這種方法可以延長保存時間，但冷凍後的豆芽口感可能會有所變化。
鹽水清洗。使用鹽水清洗豆芽可以起到殺菌消毒的作用，從而延長保存時間。
水焯法。將豆芽用開水焯1至2分鐘後瀝乾，再放入保鮮袋中密封保存。這種方法可以使豆芽保存時間更長，同時保持其脆嫩和營養。
不同種類的豆芽（如黃豆芽和綠豆芽）其保存時間和方法可能有所不同，一般來說，黃豆芽的保存時間較長。在保存豆芽時，應注意避免接觸空氣，並儘量在低溫高濕的環境中保存。如果豆芽出現發黃、腐爛等現象，應立即丟棄，避免食用。