《軒轅劍》故事內容主要包括以下部分：
1. 神農與女媧：神農氏族出身的炎帝，因魔界之亂，感懷天地萬物之不易，女媧於凡界遊歷，親眼目睹各地災亂、民生痛苦情況，認為凡界不可長治久亂，故決定造神兵結束神界亂戰。
2. 黑道日趨激烈的時代：神兵與魔器引發的混亂已經成為一個巨大的陰影，無論是正邪兩道都深陷其中。
3. 英雄時代：在這一時代中，英雄們開始出現，他們在正邪兩道中尋找自己的道路，並為了尋找神兵、破解魔界之謎而努力。
4. 英雄傳奇：英雄們在江湖中經歷了一系列的愛恨情仇、恩怨是非，他們在戰場上、情感中，面對著生與死、正與邪的抉擇。
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