遮蔽水域的含義可以從兩個主要方面來理解：
環境方面：
遮蔽水域指的是水體中存在大量懸浮物，導致水體透明度下降的區域。
航海方面：
在航海上，遮蔽水域也稱為遮蔽航區，主要指在沿海航區內，由海岸與島嶼、島嶼與島嶼圍成的遮蔽條件良好、波浪較小的海域。這些水域受到天然障礙物，如岸線、島嶼等，或其它人造障礙物，如港池、導堤、錨泊船等的遮蔽，以致瞭望受到影響的水域及其附近的水域。
另一種定義是海岸線不受未減弱的海浪直接作用的水域。
綜上所述，遮蔽水域的概念因套用領域的不同而有所區別，既可以是環境學中的概念，也可以是航海中的一個特定區域。