治療金魚腸炎的方法有多種，具體取決於腸炎的類型和症狀。以下是一些常見的治療方法：
對於一般的消化不良或飼料不乾淨引起的腸炎，可以停食一天，這通常可以緩解症狀。
如果金魚排出細長的白便，可能是消化不良引起的，停食一天通常可以解決。
對於嚴重的腸炎，可以使用慶大黴素、土黴素或利特靈泡飼料進行餵食。如果金魚拒食，可以將慶大黴素針劑直接灌食。
可以使用藥浴方法，每100升水下四五片利特靈，藥浴三天後換一半的水。
對於內寄腸炎，可以使用大白片或甲硝銼泡飼料，或者每100升水五片甲硝銼的比例進行藥浴24小時後追加同樣藥量，再過24小時後換水三分之一。
如果出現膿樣的白便，可能是細菌性腸炎，可以使用諾氟沙星加甲硝唑藥浴，用量是100升水各加四到六片，藥浴三到六天基本可以治癒。
選擇治療方法時，需要根據金魚的具體症狀和腸炎的類型來決定。