鏡音雙子的三大悲劇故事是：
1. 《殘酷な天使ソONG》：一名少女因家庭暴力而變得冷漠，最終因恨意變成無敵病毒體來侵略世界，襲擊各國首腦及貴族解決平民的生活並吸收其能力。當感覺到一絲溫情時病毒因真情感化變成惡魔之歌。《殘酷な天使ソONG》以暴力因素、病態戀愛以及學校中的無情與現實世界相撞擊等多種主題令冬粉深思。
2. 鏡音連的《爐心溶解》：故事講述的是通過一位少女的視角來描繪人類心靈深處對愛的渴望。
3. 《鬼畜眼鏡》：這是一個關於眼鏡的耽美故事，而鏡音連在其中是腹黑鬼畜的角色。這個故事探討了被社會體制和性取向所束縛的人性。
總的來說，這些故事體現了鏡音雙子在音樂和角色設定中的深度和複雜性，也反映了CRYPTON試圖在虛擬歌手市場上營造一種不同於初音未來的新形象。