長門的輪迴眼能力主要表現在佩恩六道身上，其中天道掌控了五個，分別是能將一切物理及忍術攻擊彈飛的神羅天徵，能將攻擊對象吸過來的萬象天引，能撕裂大地形成強力封印的地爆天星，能將自己的查克拉寄存在活人傀儡身上並遠程操控其戰鬥的象轉之術，最後還有組成曉組織在線聊天的幻燈身之術。人間道掌握了一箇心疼錢的能力，這個能力可以抽取靈魂探索記憶。惡鬼道掌控了一箇風速吸印，可以吸收一切以查克拉爲基礎的忍術，不管是仙術查克拉還是普通查克拉都是一樣。最後外道也就是長門本體，他掌控通靈外道魔像以及能復活死者的輪迴。
此外，輪迴眼自帶強大的查克拉和瞳力，自帶水火風土雷五種性質變化。長門十歲就能掌握六種性質變化，因爲有五種是輪迴眼大禮包，長門只需要額外掌握一種【陽】的性質變化就夠了。
長門把輪迴眼的力量分配給六道佩恩，讓他們各自擁有一種輪迴眼能力，而自己則是保留了外道之力。長門的外道之力是掌管生死的最強力量，能使用佩恩六道全部能力，並且力量還會變得更強。長門輪迴眼的外道之力最強的地方，就是操作生與死，這點和六道之力的陰陽有異曲同工之妙。六道之力的陽之力可以賦予生命，鳴人就靠這招復活了邁特凱。而長門也有一招外道輪迴天生之術，可以復活範圍內所有人。