阿朱的死因是她為了保護喬峰（蕭峰），避免喬峰與大理段家結下仇怨，而甘願代父受死。阿朱偽裝成段正淳，讓喬峰誤殺了她。這一行為是基於她對喬峰的愛情，以及她對段正淳身份的認知，即段正淳是她的親生父親，同時也是喬峰的敵人。阿朱的犧牲成為了喬峰終生的遺憾。