《隻狼：影逝二度》有多個故事分支，這些分支決定了玩家在遊戲中的不同路徑和結局。一些主要的分支包括：
1. 皇子與不死斬：玩家在遊戲早期可以選擇是否幫助皇子使用不死斬。這個選擇會影響後續劇情和角色關係。
2. 葦名城主府戰役：在這裡，玩家可以擊敗或饒恕由葦名城主派來的劍客。這個選擇將影響玩家在城主那裡的地位和後續劇情的發展。
3. 狼的主線任務：在主線任務中，玩家會遇到不同的選擇，如是否拯救被攻擊的平民，是否執行某些任務等。這些選擇將影響其他角色的命運和劇情的發展。
4. 修復連線點：玩家可以通過修復連線點來與其他區域或角色重新建立聯繫。選擇修復哪些連線點將影響遊戲的進程和結局。
5. 選擇盟友：在遊戲中後期，玩家可以選擇不同的盟友進行下一步行動。這個選擇將影響後續劇情和任務。
此外，還有許多其他的分支和選擇，導致不同的結局。遊戲的劇情和結局因玩家的選擇而異，使得《隻狼：影逝二度》具有很高的重複遊戲價值。