食品污染物主要分為生物性污染、化學性污染和物理性污染。生物性污染包括微生物、寄生蟲、昆蟲及病毒污染，其中微生物主要有細菌與細菌毒素、真菌與真菌毒素。化學性污染主要包括環境中的重金屬（如鉛、汞、砷和鎘）、農藥殘留、環境污染物（如二惡英等）、以及加工過程中的有害化學物質（如丙烯醯胺、多環芳烴和雜環胺等）。物理性污染則包括混入食品的雜質、雜物，以及放射性物質。
食品污染物可能存在於食品生產的各個環節，包括種植、養殖、加工、包裝、貯存、運輸和銷售。這些污染物可能導致食品安全性、營養充足性和感官性狀發生改變，對人體健康產生急性或慢性危害。