高壓蒸汽滅菌鍋的原理是利用高溫和高壓的蒸汽來殺死微生物，以達到滅菌的效果。
在密閉的蒸鍋內，通過加熱使水沸騰產生蒸汽，隨著壓力的增加，水的沸點相應升高，從而提高了鍋內的溫度。在這樣的條件下，蒸汽能夠滲透到物品的內部並殺死細菌和其他微生物，滅菌過程中，蒸汽的高溫和高壓會破壞微生物的細胞膜和細胞壁結構，有效殺死細菌、病毒等，從而實現徹底滅菌。
整個滅菌過程包括加熱、滅菌和排氣三個階段，加熱階段是將水加熱至沸騰產生大量蒸汽；滅菌階段是將蒸汽注入滅菌室並維持一定時間和溫度；排氣階段是排出滅菌室內的蒸汽，準備下一輪滅菌。