黑白二周目的攻略流程如下：
劇情發展。首先，紅豆杉博士的父親會來你家，幫助你將圖鑑升級為全國圖鑑。之後，你會在飛雲市遇到勁敵和他的妹妹，她夢見自己在冠軍之路等待你。
探索矢車森林。前往矢車森林，與切林組隊調查等離子團的蹤跡。在深處遇到七賢人之一的阿斯拉，調查結束後，可以從缺口處進入思索之原，了解畢力吉翁的信息。矢車森林外圍的試煉之岩可以讓隊伍中的格鬥系PM獲得星之砂。
博物館與圖書館。進入七寶市博物館選擇羽毛化石或龜殼化石，之後副館長會帶你參觀博物館。與黑白聯動後，可以進入圖書館觸發相關回憶劇情。與天桐、伯特、寇恩三人對話，可以與他們組隊進行雙打對戰。
夢之跡地。從三曜市向右來到夢之跡地，遇到拉迪歐斯/拉帝亞斯，發生戰鬥。
捕捉神獸。想要捕捉草羊獸，必須先捕捉編號為638的PM。超夢、夢幻、基拉祈等神獸的捕捉地點分別在石之洞窟、對戰開拓區、綠嶺市等。
蓋諾賽克特的劇情。先飛到雪花市，然後前往羅斯山，擊敗N後，可以找到蓋諾賽克特。
挑戰阿戴克、嘉德麗雅&竹蘭等。回到鹿子鎮，與白露對話拿會員卡，用於R9商場購買道具。挑戰阿戴克、嘉德麗雅&竹蘭等NPC。
支線任務。尋找六位賢者，與前作聯動的捕獲地點的研究員對話，了解如何使用機器傳送PM。
以上就是黑白二周目的一些主要活動和任務。祝你遊戲愉快！