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bim是什麼格式

文本格式

BIM檔案是一種在遺傳學和基因組學研究中常用的檔案格式,它包含了單核苷酸多態性(SNP)位點的位置和名稱信息。BIM檔案是文本格式,每行代表一個SNP位點,通常包括以下信息:

染色體編號:用整數標記,如22表示第22條染色體,性染色體和線粒體染色體用"X"、"Y"、"XY"、"MT"表示,而0代表染色體信息缺失。

變異標識符:每一個遺傳變異的編號,常見的SNP可以採用以"rs"開頭的編號。

位置:每個遺傳變異在基因組上的位置,用摩爾根或厘摩爾根表示。

鹼基對的坐標。

等位基因1 (A1):通常是次要等位基因(minor allele)。

等位基因2 (A2):通常是主要等位基因(major allele)。

BIM檔案與MAP檔案格式類似,但與FAM和BED檔案一起使用時,可以提供更詳細的遺傳變異信息。這些檔案通常由PLINK軟體創建和使用,PLINK是一套用於遺傳學數據分析的工具。