《新機動戰記高達W -無盡的華爾茲-》（簡稱EXS GUNDAM）的故事發生在不久的將來，地球遭到了來自宇宙和外星種族的侵略。為了保護地球，人類組建了機動戰隊，使用新型機動武器對抗敵人。故事的主角是機動戰艦中的主角妹妹塞蓮·巴拉迪爾，她在新的故事中成為了一名聯邦軍的駕駛員，駕駛著EXS高達與其他機師一起戰鬥。
在這個故事中，塞蓮等人面臨的問題不僅包括來自宇宙和外星種族的軍事力量，還包括政治、經濟和社會問題。他們需要尋找盟友，解決內部矛盾，同時還要面對敵人的攻擊。故事中充滿了緊張刺激的戰鬥場面和感人至深的情感描寫，展現了一幅未來世界中的英雄傳奇。
同時，這個故事也探討了人類面臨危機時的選擇和決策，以及個人成長和自我認知的重要性。塞蓮等人在戰鬥中不斷成長，逐漸認識到自己的價值和使命，最終成為了一名真正的英雄。這些主題也反映了人類在面對困難和挑戰時的堅韌和不屈精神。