IGV（Integrative Genomics Viewer）是一款高性能的基因組數據可視化工具，它支持互動式查看多種基因組學數據，如基因表達、突變、融合、甲基化等。IGV的界面友好，易於使用，是分析NGS數據的重要工具。
以下是一些IGV的使用步驟：
選擇基因組版本。在工具列的下拉框中，選擇與分析比對相匹配的基因組版本，例如人類的GRCh37/hg19版本。
導入BAM檔案。通過選單欄中的「File」和「Load from File…」選項導入本地的BAM檔案。確保BAM檔案對應有一個.bai索引檔案。如果沒有.bai檔案，可以使用IGV的igvtools功能生成索引。
查看數據。IGV的主界面分為多個區域，包括工具列、軌道區域（顯示甲基化、基因表達等信息）、特徵顯示區和屬性面板等。在軌道區域，可以通過選擇染色體或輸入具體位置（如基因名或位置區間）來查看數據。
此外，IGV還支持查看序列比對結果、可變剪下情況、變異等數據。用戶可以通過右鍵選單訪問各種功能，如拷貝序列、顯示所有鹼基等。
IGV支持多種數據格式，包括BAM、SAM、CRAM等比對檔案以及RNA-seq數據。安裝IGV時，用戶應根據自己的作業系統選擇合適的版本，並確保Java 11的支持。