QPCR的Cq值，也稱為Threshold cycle (Ct)，是指在閾值線法下，螢光信號與閾值線交叉時的循環數。這個值在螢光定量PCR（QPCR）中非常重要，因為它與模板的起始拷貝數存線上性關係，起始模板量濃度越高，Cq值越小；起始模板量濃度越低，Cq值越大。
在實驗中，儀器軟體通常將第3-15個循環的螢光值設為基線，閾值一般是基線的標準偏差的10倍，高於閾值的螢光信號被認為是真實的信號。由於每次實驗的基線可能不同，閾值和Cq值也會受到影響，因此Cq值並不是恆定不變的，它可以受到不同樣品、不同預混液、不同儀器的影響。
此外，QPCR的檢測靈敏度，也稱為分析敏感性/檢測限/最低檢出限(LoD)等等，是指某一分析方法在給定的可靠程度內可以從樣本中重複檢測待檢測物質的最小濃度或最小值。