RNA降解的原因可以歸納為以下幾個方面：
物理因素：包括溫度變化、機械剪下力、核酸的反覆凍融、高溫煮沸以及輻射等。
化學因素：如PH值的變化、水解反應和氧化反應等。
生物因素：主要是酶解作用，如核酸酶的作用，以及微生物侵染等。
實驗操作因素：
新鮮細胞：裂解液不足可能導致RNA未被充分釋放。
新鮮組織：含有內源性核酸酶的組織難以避免RNA酶的降解。
冷凍樣品：未經液氮速冷直接存放會導致RNA緩慢降解。
外源RNA酶的污染：實驗試劑、器械等應進行DEPC水滅菌處理以消除污染。
內源RNA酶的污染：抑製劑失效或用量不夠，樣品過多或勻漿溫度過高都可能導致污染。
長時間暴露於高溫或光照：RNA易受紫外線和高溫影響而降解。
提取過程中的反覆冷凍解凍：會破壞RNA結構，使其更易受酶作用而降解。
其他因素：
核酸染色異常，如28s:18s比例失真，可能導致誤判為降解。
電泳槽、電泳緩衝液、上樣緩衝液等物品污染RNA酶，導致RNA在電泳過程中降解。
RNA提取濃度過高，上樣量過大，也可能導致電泳時降解，從而誤判為RNA降解。
綜上所述，RNA降解的原因多樣，包括物理、化學、生物以及實驗操作等多種因素。在RNA提取和實驗過程中，應採取適當措施以減少RNA的降解。