RNA降解的原因主要包括以下幾點：
RNA酶的作用。RNA酶是專門降解RNA的酶，在細胞中廣泛存在，即使在提取過程中也難以完全避免RNA酶的污染，這些酶會迅速降解RNA分子。
環境因素的影響。包括pH值和溫度的變化。在鹼性條件下，RNA的鹼基可能被脫氨基，導致鏈斷裂。高溫也會引起RNA分子的部分或完全降解。因此，在提取和保存RNA的過程中，需要注意維持適宜的pH和溫度條件。
氧化損傷。氧氣可以引發RNA的氧化損傷，特別是在開放的環境下或長時間存儲的情況下，氧化反應會加速RNA的降解。RNA中的磷酸骨架和鹼基易受氧化劑的攻擊，進而導致鏈斷裂。
純度問題。如果提取的RNA純度不高，其中可能含有降解RNA的物質，如RNase等，進而加速RNA的降解。因此，在提取RNA的過程中，需要嚴格控制提取方法和純化步驟，確保RNA的純度達到足夠高的水平。
實驗操作問題。例如，新鮮細胞或組織處理不當，如裂解液量不足、內源性核酸酶的存在，或樣品未經過液氮速冷直接存放，都可能導致RNA降解。此外，外源和內源RNA酶的污染、電泳液不乾淨或過熱也會影響RNA穩定性。
總的來說，RNA降解的原因複雜多樣，包括酶的作用、環境因素、氧化損傷和實驗操作等多個方面。