《敵營三部曲》講述了以下故事：
1. 第一部《苦境》，主要講述了共產黨游擊隊在絕望的環境下如何苦鬥，並在絕望中尋找希望的故事。
2. 第二部《破曉》主要描述了共產黨游擊隊在絕望環境中尋找希望，面對國民黨軍的追捕，他們如何自我拯救的故事。
3. 第三部《曙光》主要描述共產黨游擊隊與國民黨軍在黨派思想、信仰、情感以及人性等方面碰撞，以劇情形式呈現了黨建領袖的智慧，也讓讀者看到國民黨軍中存在一種由少數領袖操縱的逆流暗流。
故事還涉及到了抗日戰爭中的思想解放、人性探索等內容。
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