乳酪的保存方法取決於其類型和質地，以及是否計劃在短期內使用。一般來說，乳酪應該存放在乾燥、密封、避免陽光直射的地方。以下是不同類型乳酪的保存方法：
新鮮乳酪。通常盛裝在塑膠或玻璃容器里，只需蓋好放在冷藏室中即可，保存時間約為1到2周。
軟質乳酪和半硬質乳酪。如果一次無法吃完，套用原包裝紙包好，放入保鮮盒中冷藏保存。如果原包裝是真空塑膠袋，可用鋁箔包好再放入保鮮盒中，以避免乳酪變乾。軟質乳酪可以冷藏保存約一周，而半硬質乳酪則可達一個月左右。
硬質乳酪。可以冷藏數月甚至在成熟環境下可達一兩年。硬質乾芝酪磨碎後應放置在密封容器中冷藏，保存期限約2周。若需長期保存，則應冷凍。
奶油乳酪。可以切成所需厚度後，用保鮮膜緊密包裹並排出空氣，然後放入保鮮盒中冷藏。建議在1到2周內使用完畢。
此外，對於未切開的乳酪，可以放置在保鮮袋中真空保存，並在袋內放入幾個酒精棉球後密封放入冰櫃冷凍。重要的是確保所有接觸乳酪的物品都是乾淨的，以避免污染。冷凍後的乳酪在使用前應進行充分解凍，為防止解凍過程中微生物的污染和繁殖，推薦在0到4℃的環境下緩慢解凍。按照需求購買乳酪，因為新鮮乳酪的風味最佳。