生態單元（ecological unit），也稱爲生態單位或生態元，是生態學中的一箇基本概念。它指的是存在於一定空間和時間中的，與其環境相互作用的具有一定結構和功能的生命單元。生態單元具有不同的等級層次，包括個體、種羣、羣落、生態系統和生物圈。這些單元在特定尺度下環境條件一致，可以是一處開放的草地、林地、溼地、荒漠或農田等，它們具有特殊的環境和特定的生物羣體。溼地生態單元的定義最初是指任何可以圈定的溼地動植物可以生存的空間，或者是溼地生態系統裏可以劃分的空間單位，後來發展到指具有相同或相似環境條件的，並且能夠爲溼地動植物羣落提供的生存環境區域。