何兆武的著作包括《必然與偶然》《衝擊與反響》《思想的葦草》《何兆武思想文化隨筆》《歷史理性批判散論》《歷史與歷史學》《中國思想發展史》《中西文化交流史論》《文化漫談》《葦草集》以及口述史《上學記》。
何兆武的《中國思想發展史》系統地闡述了中國從先秦到五四運動前夕的思想發展脈絡，深受讀者和學術界的喜愛。此外，他的《上學記》也是廣爲流傳的作品，記錄了他從小學到大學的經歷和思考。何兆武的學術貢獻不僅限於著作，他還翻譯了多部西方學術著作，如盧梭的《社會契約論》、康德的《歷史理性批判文集》等，爲中國的學術和文化交流做出了重要貢獻。