分辨真假水晶可以通過以下幾種方法：
觀察顏色和紋理。天然水晶通常呈現白、粉、茶、黃、紫、紫黃等顏色，且內部可能含有生長紋理，如棉、裂等。假水晶則顏色單一，內部純淨無暇。
測試硬度。天然水晶的莫氏硬度為7，用鋒利的刀具在其表面刻畫一般不會留下痕跡。而假水晶多為玻璃仿造，硬度較低，容易留下劃痕。
感受比重和溫度。天然水晶的手感溫潤細膩，導熱性好，即使在炎熱的環境中，也能保持一定的涼爽感。而假水晶手感粗糙，導熱性差。
觀察光澤和反光。天然水晶表面多呈玻璃光澤或油脂光澤，陽光下能明顯看到反光。假水晶光澤度不高，顯得較為暗淡。
使用偏光鏡。天然水晶在偏光鏡下轉動時，會顯示似明似暗的變化，而假水晶則沒有這種現象。
檢查內部特徵。天然水晶內部可能含有冰裂紋、棉絮、雲霧狀物、礦缺、共生礦等特徵。這些特徵是天然水晶在形成過程中自然形成的。
觀察色帶和雙折射性。天然水晶在生長過程中可能因環境變化而出現色帶，且具有雙折射性，透過水晶看頭髮絲時，可以看到雙影。
使用放大鏡。用十倍放大鏡檢查，能找到氣泡的基本上可以定為假水晶。
專業鑑定。如果不確定水晶的真假，可以將其帶到專業的珠寶鑑定機構進行檢測，鑑定機構會出具鑑定證書。
以上方法並非絕對，高品質的仿造水晶可能難以通過這些方法完全區分。因此，最可靠的鑑別方式還是通過專業的鑑定機構進行鑑定。