工程碩士的專業主要包括電子信息、機械、材料與化工、資源與環境、能源動力、土木水利、生物與醫藥、交通運輸等8個專業學位類別。此外，還包括機械工程、光學工程、儀器儀表工程、材料工程、冶金工程、動力工程、電氣工程、電子與通信工程、控制工程、計算機技術、建築與土木工程、水利工程、測繪工程、化學工程、地質工程、礦業工程、石油與天然氣工程、紡織工程、輕工技術與工程、交通運輸工程、船舶與海洋工程、兵器工程、核能與核技術工程、農業工程、林業工程、環境工程、生物醫學工程、食品工程、航空工程、航天工程、車輛工程、製藥工程、工業工程、工業設計工程等38個領域。