南京南站進站的方法主要有捷運和開車兩種。
如果是乘坐捷運，可以先乘1號線、3號線、S1號線或S3號線到達南京南站。然後根據檢票口選擇出站口，例如檢票口在1-10，可以選擇北進站口，檢票口在15以上，可以選擇南進站口。出站後，需要走一段路到達進站口，建議預留至少10分鐘。
如果是開車，可以選擇南進站口或北進站口。如果檢票口在1-14，從北進站口更近，檢票口在15-28，從南進站口更近。北平台可能會車多緩行，如果可以的話，建議前往南平台。車輛可以在南北平台落客，但需即停即走，且不可以上客。
此外，南京南站還有多個停車場，包括P1-P7，可以根據需要選擇。