去糖基化酶是一種用於去除糖蛋白或糖多肽中N-連線糖鏈的酶。這些酶根據其作用方式和糖鏈的特性，可以分為不同的類型：
糖苷內切酶：這類酶能夠水解糖鏈中的糖苷鍵，釋放出糖鏈。例如，PNGase F和Endo S酶可以去除N-連線糖鏈，其中PNGase F酶能夠切割高甘露糖型、複合型、雜合型糖鏈，而Endo S酶則能夠從IgG中去除N-連線糖鏈。
糖苷外切酶：這類酶能夠水解糖鏈中的糖苷鍵，釋放出糖鏈。例如，唾液酸酶和β-半乳糖苷酶可以水解糖蛋白中的唾液酸殘基和半乳糖殘基，而α-甘露糖苷酶是一種高特異性糖苷外切酶。
混合酶：在某些情況下，單一酶去糖基化可能無法達到完全去除糖基的目的，因此需要多種酶的混合使用。混合酶可以針對糖的不均一性，如唾液酸糖基化或二等分N-乙醯葡萄糖胺的存在，更有效地去除糖基。
去糖基化酶的套用非常廣泛，它們在生物醫學研究、藥物開發、疾病診斷和治療等領域發揮著重要作用。例如，在抗體、免疫球蛋白融合蛋白或其他糖蛋白的體外去除N-糖基化修飾反應中，PNGase F酶是一種常用的工具酶。此外，去糖基化酶的研究對於理解糖蛋白的結構和功能、以及糖生物學工具酶或藥物開發的創新套用研究具有重要意義。