《口袋妖怪珍珠版》的攻略如下：
遊戲 開始 時， 選 擇自己的名字和 對手的名字，然 後下 樓 與 媽 媽 對 話，了解 對手在等你，出 門 後在 鎮子左上角找到 對手的家， 與 對手 對 話 後， 前往心 齊湖畔，在 那裡遇到博士和小光，之 後 會遇到野生 寶可 夢， 選 擇御三家 寶可 夢 進行 戰鬥， 戰鬥 結束 後，回家， 媽 媽 會 給你跑步鞋，然 後 前往真砂 鎮找博士，在研究所 內 與博士 對 話 後，正式 獲得你 選 擇的 寶可 夢和 圖鑑，出 門 後 媽 媽 會 給你冒 險 筆 記。
從真砂 鎮上方前 進到 達祝 慶市，在祝 慶市 進入 訓 練家 學校 與黑板旁的 對手 對 話 後 獲得城 鎮地 圖， 與祝 慶市左 側的 釣 魚大叔 對 話可以 獲得破 舊 魚竿，在祝 慶市右 側203 號道路 會遇到 對手 觸 發 對 戰， 繼 續前 進 進入山洞黑金 閘口，入口 處大叔 會 獲得招式 學 習器98 「碎岩 」，在黑金 閘口深 處 與 紅色安全帽的人 對 話 後就能 進入道 館了，回到黑金市 進入道 館挑 戰 館主瓢太， 獲 勝 後 獲得煤炭徽章，同 時 獲得招式 學 習器76 「 隱形岩 」，在黑金市道具店左 邊房 間 內可以用腕力交 換 凱西。
回到祝 慶市，往204 號道路前 進 觸 發 劇情， 擊 敗 兩個 銀河 隊成 員， 從204 號道路到 達花苑 鎮，在花苑世界花 店裡左 側女孩 對 話 獲得可 達 鴨 噴 壺，回到 山谷 發 電 廠 與 門前的 銀河 隊的人 對 話 進入 戰鬥， 擊 敗 銀河 隊 後 發 電 廠人 員 會告 訴你 飄 飄球的出 現 條件。
帷幕市向下走214 號道路有挺多 訓 練家可以 練 級， 來到下方立志湖畔， 進行 對 戰，一路探索 來到野原市，打 敗道 館 館主 獲得 濕地徽章，出 來大 門口有 個 銀河 隊， 對 話 後 趕去立志湖， 繼 續向上 觸 發 劇情去 攔路的可 達 鴨 那裡 並得到秘 傳之 藥。