《古 劍奇 譚 網路版》的 劇情涉及多 個 線索和故事 線，以下是一些 關 鍵 點：
清 濁二分 與荒神 晉 蒼。 劇情 從清 濁二 氣之分 開始，涉及荒神 晉 蒼的故事 線。 楊紫作 為清哲教教主，在 臥底百草谷 十年 後被同心骨 控制，背叛 並 盜走了 樂家的 無名之 劍。 儘管被 控制， 楊紫一直在 尋找 擺 脫 蠱毒的方法， 並在 關 鍵 時刻 採取了反制行 動， 給予 驚 蟄教及 蒼骨沉重一 擊。
驚 蟄教 與其他邪修 勢力的勾 結。仙家弟子在追查百草谷的 過程中， 會 發 現 驚 蟄教 與其他邪修 勢力如不老檀郎、瘟 會等勾 結，共同 對天下 蒼生造成危害。
上古神 話 時代的天柱 傾塌 與瘟神。在天柱 傾塌之 後，清 濁二 氣混 亂交 雜，瘟神出 現。瘟神性情喜 惡 無常， 對 包括自己的信仰者在 內的一切生 靈都毫不 關心，喜 歡 惡作 劇，尤其 樂 於 測 試人性。
秦陵生 變 與魔 龍燎煞。秦陵生 變的 劇情是 遊戲中的另 一個重要故事 線。秦始皇 時期，邪 惡方 術士 羨 門 澤在秦陵中打造了不朽 軍 團， 結果引 來了魔 龍燎煞。魔 龍 與 羨 門 澤 達成 協定， 雙方互助以 顛覆天地。九 百年前， 羨 門 澤率 領不朽 軍 團欲 衝出秦陵，但被百草谷中的冠月木 預知 並警告。最 終， 經 過一 場大 戰，魔 龍被封印，但五位高手也身受重 創。
以上是《古 劍奇 譚 網路版》中的一些 關 鍵 劇情 點。 遊戲的故事 線 複雜且涉及多 個角色和 勢力，展 現了 一個充 滿神 話色彩和史 詩般 戰鬥的世界。