咖啡豆的研磨可以通過多種方式進行，包括使用研缽和研杵、錘子、擀麵杖，或者使用咖啡豆研磨機。使用研缽和研杵時，應先少量放入咖啡豆，以免飛出研缽，熟練後再適量增加咖啡豆。使用錘子時，應將咖啡豆放在塑膠袋或羊皮紙中，這種方式磨出的咖啡粉會比較粗。使用擀麵杖時，需要不停地來回滾動，直到咖啡豆的粉末達到所需的粗細。而使用咖啡豆研磨機則更加方便快捷。
磨豆機的發明之前，人們使用石制的杵和缽來研磨咖啡豆，據說這種古老的工具磨出的咖啡粉能夠泡出香醇的風味。咖啡豆的研磨粗細可以根據烹煮方式的不同而有所變化，例如機器製作的咖啡需要較細的咖啡粉，而美式濾滴咖啡製作時間較長，因此咖啡粉的研磨較粗。
咖啡豆的研磨工具主要有手動迴轉式磨豆機、電動式磨豆機和電動磨豆機。手動迴轉式磨豆機適合需求量小、顆粒較大，以及喜歡休閒的人士。電動式磨豆機可以磨出各種顆粒大小的咖啡粉，適合家庭使用，而專業用電動磨豆機則用於商業用途，可以一次磨出一磅以上的咖啡粉。
研磨咖啡豆時，應注意降低研磨熱以避免咖啡香味提早溢散，以及確保顆粒大小均一，以便於掌握沖泡時間。